Пересобранные белки в опытах усилили атаку иммунных клеток на опухоли

Идея метода — не проектировать белок с нуля, а переставлять готовые «детали» внутри семейства родственных белков. Учёные синтезировали такие новые сочетания доменов — участков белка с определённой функцией — и добавили их в человеческие Т-клетки, то есть иммунные клетки, способные распознавать мишень. Главный вопрос был в том, можно ли получить свойства, которых нет ни у одного природного варианта белка.

Особенно подробно проверили новые факторы AP-1 — белки, которые включают и выключают гены. В клетках они запускали широкую перенастройку работы генов и эпигенетики, то есть химических меток и упаковки ДНК, влияющих на доступность генов. В результате Т-клетки одновременно сохраняли способность убивать опухолевые клетки, не переходили полностью в состояние истощения и дольше сохранялись. Некоторые их свойства напоминали программы, обычно встречающиеся у других типов клеток.

Учёные также выяснили, как это происходит. Новые белки в основном не находили совершенно неизвестные участки ДНК: они по-другому регулировали уже знакомые участки, на которых обычно работает AP-1. Это важная деталь — эффект возникал не просто из-за нового места связывания, а из-за иной настройки давно существующей системы управления генами. Дополнительные варианты из семейств ETS и FOX дали похожий аргумент в пользу того, что подход может работать не только с AP-1, хотя абстракт не сообщает подробностей этих проверок.